Sejak bermulanya Kejohanan Futsal AFF pada tahun 2001 di Kuala Lumpur, Pasukan Malaysia tidak pernah terlepas untuk menyertai kejohanan ini sehingga kini.
Kini kejohanan futsal AFF ini sudah memasuki edisi ke 13 yang baru sahaja berakhir semalam dimana pasukan Thailand berjaya mengekalkan kejuaraan.
Bagi pasukan Malaysia mereka berjaya peroleh tempat ke 3 di AFF Futsal 2016 setelah menewaskan pasukan Timor Leste. Pencapaian terbaik pasukan Malaysia di kejohanan ini adalah peroleh tempat kedua pada tahun 2010 dimana kejohanan AFF ini berlangsung di Vietnam.
Berikut merupakan pencapaian pasukan Malaysia di kejohanan futsal AFF
Malaysia (2001) – Ketiga
Malaysia (2003) – Kedua
Thailand (2005) – Kedua
Thailand (2006) – Kumpulan
Thailand (2007) – Ketiga
Thailand (2008) – Ketiga
Vietnam (2009) – Kumpulan
Vietnam (2010) – Kedua
Thailand (2012) – Keempat
Thailand (2013) – Kumpulan
Malaysia (2014) – Kumpulan
Thailand (2015) – Ketiga
Thailand ( 2016) – Ketiga